Охрана акватории, где обитает множество редких видов морских животных, является одной из важнейших задач заповедника «Командорский» – самого большого морского заповедника России. Охрана акватории площадью более 3 миллионов гектаров осуществляется двумя основными способами: патрулированием и осмотрами акватории, которые проводят инспекторы заповедника, и мониторингом через спутниковую систему наблюдений за судами.

С начала 2015 года во время морских патрулирований инспекторы заповедника прошли более 1500 километров. Охраняемая акватория была осмотрена сотни раз в бинокли и подзорные трубы. Система спутникового мониторинга используется заповедником уже несколько лет – она позволяет в режиме реального времени получать информацию обо всех крупных судах, зашедших в охраняемую акваторию. Такой контроль за соблюдением заповедного режима стал возможен благодаря совместной программе заповедника «Командорский» и Инженерно-технологического центра «СканЭкс».

Российские корабли редко заходят в заповедную акваторию, не получив разрешения заповедника, однако случаются и досадные исключения. Так, с 6 августа без соответствующего разрешения в охраняемой акватории находится научно-исследовательское судно «Академик Опарин». Владельцам судна и капитану грозит серьезный штраф за нарушение режима особо охраняемой природной территории. За нынешний год это второй случай незаконного захода российского судна в охраняемую акваторию заповедника «Командорский».